為更好地推進“十一五”污染減排進度，我國對沒有做好減排工作的地方政府，實行問責制度。環境保護部副部長張力軍３日在國新辦舉行的發布會上說，行政問責是根據國務院節能減排綜合性工作方案的要求，由監察部實施的。問責制有力地推進了“十一五”節能減排的進度，有力地促進了減排目標的實現。

《２００９年中國環境狀況公報》指出，２００９年，國務院召開了節能減排工作領導小組第三次會議，國務院辦公廳印發了２００９年節能減排工作安排。發布了上年各省（自治區、直轄市）以及國家電網公司和五大電力集團公司主要污染物總量減排考核結果及２００９年上半年各省（自治區、直轄市）主要污染物排放量指標公報，對問題突出的部分地區和企業公開通報，責令限期整改或予以經濟處罰；對２００９年上半年減排進度較慢的８省（區）進行書面預警，約談當地政府主要領導，進行督查指導。

嚴格的考核問責引起了地方政府的重視。各地紛紛創新招數，強化措施：河北頒布了《減少污染物排放條例》；河南出臺了《水污染防治條例》；貴州制定了《主要污染物總量減排攻堅工作行政問責辦法》，對城市污水處理設施建設進度嚴重滯后的市（州）、縣政府領導進行誡勉談話；廣西對未按計劃完成城鎮污水處理設施建設的４７位市（縣）政府主要領導向全區發出通報；江蘇、浙江著手編制鎮級污水處理設施建設規劃；遼寧、江西、湖北等省全面推進污水處理一縣一廠建設；甘肅、新疆、青海等地在財力不足的情況下擠出資金支持重點治污項目建設，有力地推動了減排工作的深入開展。