汕頭保稅區以其特有的區位優勢和優質的通關環境成為粵東煤炭進口的首選口岸。2010年汕頭海關下屬的保稅區海關累計監管進口煤船101艘次，貨運量達297萬噸，共征收稅款2.4億元。

近年來粵東能源企業對進口煤炭的需求呈上升趨勢，汕頭海關通過調研分析，針對煤炭這種大宗散裝貨物的特點量身打造了“提前申報、即到即卸、卸畢即離”的特殊通關監管方式，通過縮短碼頭作業時間，減少船舶滯港期來提高進口煤的通關速度，大幅度節約了企業的經營成本。此外，創新“取樣”的工作方式，針對進口煤取樣送檢時存在取樣難度大、送檢周期長的問題，采用“三方分樣”的方式進行取樣（即海關、廠方、商檢三方同時到場抽取貨樣），確保樣品的科學性和準確性。一系列針對性便捷通關措施極大地方便原煤的進口。2010年從保稅區進口的煤炭貨運量占汕頭關區進口總量27%，征收稅款占汕頭關區煤炭稅收總量26%。