一個項目想成為CDM項目，要完成聯系購買方、選擇減排技術、項目環評、項目立項和項目申報等工作。我國企業申報項目，要通過國家發改委審批、第三方的認證并在聯合國CDM理事會成功注冊。

CDM機制的第一個風險是項目審批程序具有不確定性，政府審批的風險和聯合國注冊的風險需要考慮。申報CDM項目要履行國際、國內兩套程序并經過多個機構審批。一個項目從申請到獲得批準，至少需要3~6個月時間。

而程序太多使項目能否審批成功具有不確定性。在審批之前，設計審批方案和給項目“包裝”的環節要花費至少10萬美元。一旦項目審批不成功，這些費用就“打了水漂”。

CDM機制的第二個風險是可能出現價格戰等惡性競爭。目前，國際CDM市場是買方市場，來自發展中國家的“賣方”企業處于弱勢。隨著各國對CDM機制了解程度的不斷加深，更多的發展中國家的企業將成為減排指標的供應商。供大于求的情況可能出現，導致發展中國家企業通過打價格戰等惡性競爭出售指標，最終企業收益會大幅下降，甚至可能發生投資無法收回的情況。

CDM機制的第三個風險來自政策方面。我國是發展中國家，目前沒有受到《京都議定書》限制，實行強制性減排。但我國經濟快速發展，未來在碳排放量方面會受到越來越嚴格的約束。我國環保部門專家預測，未來我國會成為CDM項目的買方，要大量買進CDM指標。屆時，許多打算賣指標的國內企業可能會遭受政策打擊。

第四個風險來自發達國家“買家”。發達國家的企業購買減排指標是出于減排壓力以及在其國內減排成本高的壓力。目前，發達國家減排1噸二氧化碳當量的溫室氣體平均要花費80美元，而通過CDM項目購買指標只需花費14美元，減排成本降低了80%。一旦發達國家不再履行減排義務或出現可以大幅降低減排成本的技術，許多企業將不再購買減排指標。