哥本哈根氣候變化大會16日出現激烈交鋒。主席國丹麥違反大會程序，試圖自作主張將一份私下擬訂的協議草案強加給大會討論，引起發展中國家的強烈反對。

當天中午，新任大會主席、丹麥首相拉爾斯·勒克·拉斯穆森試圖啟動高層會議，邀請一些國家和國際組織領導人到會發表講話。但按照大會程序，在此之前，《聯合國氣候變化框架公約》長期合作特設工作組和《京都議定書》特設工作組應分別提交一份報告，作為高層會議階段討論的基礎。

但是，拉斯穆森在兩個工作組尚未提交報告的情況下，以推動談判為借口，試圖將主席國準備的一份草案提交給高層會議討論。會上，巴西代表率先對大會主席違反程序的做法表示反對，并得到了中國、印度、南非等發展中國家的廣泛支持。

中國代表團副團長、氣候談判中方首席談判代表蘇偉嚴正指出，這絕不是一個程序性問題，而是一個實質性問題，大會主席不能未經各國代表討論，憑空拿出一個草案，這種做法不符合透明原則，是對與會各國的不尊重。

這一爭議看似程序性，但背后卻是發達國家和發展中國家在談判堅持雙軌制還是單軌制上的較量。

根據2007年達成的“巴厘路線圖”，目前的氣候變化談判應當堅持雙軌制，即《京都議定書》下的談判，以及發展中國家和未簽署《京都議定書》的發達國家（主要是指美國）在《聯合國氣候變化框架公約》下就長期的、更廣泛的減排行動進行談判。

《京都議定書》規定了發達國家應接受強制減排義務，發展中國家自愿減排，但發達國家試圖拋開《京都議定書》另起爐灶，締結一份包括美國等所有國家在內的單個法律文件，逃避自身責任并讓發展中國家承擔更多減排義務，實行所謂的單軌制。

會上，發展中國家普遍主張，不能扼殺《京都議定書》。盡管在談判過程中，發達國家口頭上表示堅持雙軌制，實際卻一直在拖延《京都議定書》特設工作組下的談判，試圖達到以單軌制取代雙軌制的目的。

迫于來自發展中國家的壓力，身為大會主席的拉斯穆森同意在當天晚些時候繼續進行《京都議定書》特設工作組的談判。

16日早些時候，拉斯穆森接替丹麥前氣候與能源大臣康妮·赫澤高，成為本次氣候大會新任主席，赫澤高將以特別代表的身份繼續參加大會。赫澤高對此解釋說：“這屬于程序性變更，因為在目前多國領導人前來參加會議的情況下，由首相拉斯穆森擔任大會主席更為合適。”但此前，許多發展中國家代表認為赫澤高在談判中偏袒發達國家。