2009年是三峽工程從建設階段全面轉入運行階段的第一年，三峽工程初步設計建設任務（除批準緩建的升船機外）如期完成，汛后三峽水庫試驗性蓄水至高程171.4米，全面發揮防洪、發電、航運、生態補水等綜合效益。

  2009年，三峽大壩壩址累計來水3881億立方米，比多年平均值偏少13.9%。汛期，三峽工程有效發揮防洪作用，最大削減洪峰流量15000立方米每秒，減輕了長江下游的防洪壓力。在枯水季節，三峽水庫對下游實施補水調度，累計補水127.3億立方米，保障了長江中下游通航水深和生產生活用水要求，為緩解旱情發揮了重要作用。

  2009年，三峽左、右岸26臺機組全部投入運行，汛期首次達到全廠額定出力1820萬千瓦，機組運行穩定，全年發電798.53億千瓦時。

  2009年，通過三峽樞紐貨運量再創新高，達到7426萬噸，比上年增長8.5%。其中，通過船閘貨物6089萬噸，比上年增長13.39%，保持了連續六年兩位數高速增長；翻壩滾裝貨物1337萬噸。

  三峽工程后續工程正有序推進，其中：右岸地下電站進入金結安裝施工高峰階段，工程進度滿足2011年和2012年各投產3臺機組的目標要求；升船機正在進行塔柱施工及金結設備制造。