隨著一系列污水處理技改措施的完成，神華鄂爾多斯煤制油項目各種凈化水水質得到明顯提升，幾乎全部得到回用，真正實現零排放的目標。其中，污水回用率達到98%以上，除僅有200-300噸/天的蒸發器濃縮液需排至蒸發塘外，無其他污水外排。同時，污水的回用大幅降低了新鮮水的消耗。全廠生產用新鮮水消耗量已由設計的30000噸/天降低至18000噸/天以內，大幅減少了新鮮水的消耗和水源地取水量。這是神華鄂爾多斯煤制油分公司總經理張傳江在6月6日召開的2014年中國國際煤化工發展論壇煤化工環保專題交流座談會上對外發布的。

據張傳江介紹，除了設計階段高達8.7億元的環保處理投入外，在2009-2014年期間，神華鄂爾多斯煤制油分公司對高濃度污水處理的投入達4億元。 

去年7月份，綠色和平組織曾在京發布《噬水之煤——神華鄂爾多斯煤制油項目超采地下水和違法排污調查報告》指出，神華鄂爾多斯煤制油項目與民爭水，導致取水地區農牧區生態環境嚴重退化，且項目還利用滲坑違法偷排超標污水。 

但據記者在會上了解，目前業內的普遍看法是：目前沒有一家煤化工企業或者項目能實現真正意義上的零排放，即廢水的全部回用。神華的這一報告也沒有能夠改變這一看法。與會的業內人士告訴記者，神華鄂爾多斯煤制油項目的污水排放準確來說應該是近零排放。因為該項目仍然有200-300噸/天的高鹽水排放至蒸發塘。考慮到鄂爾多斯當地降水量和蒸發量的實際情況，尤其是鄂爾多斯至少有5個月左右的冰封期是沒有蒸發量的，蒸發塘里的高鹽水是否會排放到外面，仍然值得關注。目前內蒙古當地有好幾個蒸發塘已經水滿為患。南京工業大學教授徐炎華指出，煤化工水污染之所以難以處理的原因主要包括以下幾方面：煤質不同、產品和生產工藝相關等因素導致的水質“差異性”；生物毒性高、污染物成分復雜且水質波動大造成的水質“復雜性”；廢水處理工藝針對性、有效性不足；缺乏經濟有效的預處理即缺乏適用于具體水質特征的個性化節水減排整體解決方案 

一些代表對目前神華鄂爾多斯煤制油項目噸水處理成本在20元左右也表示難以接受。上海東碩環保科技有限公司董事長陳業鋼認為，這個成本是比較貴的。如果加上高鹽水接近60元/噸的處理成本，企業在廢水上支出的成本會更高。所以，不到萬不得已，企業很難會對廢水真正愿意做到完全處理的。或許將煤化工行業環境污染交給專業的第三方治理是一個更好的選擇。